遗传图谱构建和QTL定位
遗传图谱也叫连锁遗传图谱(Genetic linkage map),是以基因或者遗传标记之间的连锁和重组交换值构建的图谱。QTL 定位是通过对遗传标记与性状之间相关性的分析,将一个或多个QTL 定位到染色体的遗传标记之间。 康普森提供基于基因芯片和高通量测序的高密度遗传图谱构建及QTL 定位服务,助力重要育种价值基因的挖掘。
Sample requirements
材料准备
首先需要构建作图群体进行高质量遗传连锁图的绘制,然后测定作图群体中不同个体或株系的标记基因型;对标记基因型数据进行连锁分析,构建标记连锁图。然后将QTL定位在遗传图谱上,确定QTL与遗传标记间的距离(以重组率表示)。
作图群体
临时作图群体:F1、F2、BC等永久作图群体:RIL、NIL、DH等分子标记
SSRSNP模型选择
区间作图法 IM复合区间作图法 CIM多重区间作图法 MIM
Schematic diagram
技术示意图
结果展示
文章使用Affymetrix 小麦 660K SNP 芯片对六 倍体小麦进行检测。由此得到全长4424.4 cM 包含 11566 个标记的高密度遗传图谱,其中119001 个位 点为SNP 标记。
◎ Cui, F. , Zhang, N. , Fan, X. L. , Zhang, W. , Zhao, C. H. , & Yang, L. J. , et al. (2017). Utilization of a wheat660k snp array-derived high-density genetic map for highresolution mapping of a major qtl for kernel number. Scientific Reports, 7(1), 3788.